Open Signaux Faibles

Configuration

Installer le projet

$ git clone git@github.com:SGMAP-AGD/opensignauxfaibles.git

Installer la librairie opensignauxfaibles

• Ouvrir RStudio

• Ouvrir le projet opensignauxfaibles et taper :

  library("packrat")
  on()
  library("devtools")
  build()
  install()

PostGreSQL

Les données sont chargées dans une base de données PostGreSQL

Le fichier keys.json à la racine du dossier contient les paramètres de connexion la base PostGre.

{
  "host": [""],
  "dbname": [""],
  "port": [""],
  "id":[""],
  "pw":[""]
}

Charger les données brutes

• Les données brutes sont dans le répertoire data-raw/.
• Le programme import_data.Rmd importe toutes les données brutes dans la base PostGre avec le préfixe table_.
• Les fonctions appelées dans import_data.Rmd sont définies dans R/import_data.R.

Calcul des variables

• Le programme compute_samples.Rmd permet de calculer l'ensemble des variables
• Les fonctions appelées dans compute_samples.Rmd sont définies dans R/compute_samples.R

Calcul des prédictions

• Le programme compute_model_0_12.Rmd permet de calculer les prédictions à 12 mois.